遺伝子発現量ダイナミックスにおける自己相似性について

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2005-07-25
• タイトル: 遺伝子発現量ダイナミックスにおける自己相似性について
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Self-similarity symmetry in gene expression dynamics
• 言語: eng
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター
• 著者所属: 京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター
• 著者所属: 京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Bioinformatics Center Institute for Chemical Research Kyoto University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Bioinformatics Center Institute for Chemical Research Kyoto University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Bioinformatics Center Institute for Chemical Research Kyoto University
• 著者名: 落合, 友四郎; J.C.Nacher; 阿久津, 達也
• 著者名(英): T.Ochiai; J.C.Nacher; T.Akutsu
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 今回、ヒトと酵母の遺伝子発現量の時系列データを解析することにより、遺伝子発現のダイナミックスを記述する基礎方程式を導いた。（ここで、ダイナミックスとは遺伝子発現量が時間とともにどのように変化するかということである。）この方程式には興味深いことに、ある種の不変性（自己相似性、スケール不変性）が存在する。この自己相似性により、観測されている遺伝子発現量のスケール則（分散と平均の関係）を説明することに成功した。
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: In this article, we analyze the gene expression dynamics (i.e., how the genes expression fluctuates in time) by using a new constructive approach. This approach is based on only two fundamental ingredients: symmetry and the Markov property of dynamics. First, by using experimental data of human and yeast gene expression time series, we found a symmetry in short-time transition probability from time t to time t+1. We call it self-similarity symmetry (i.e., surprisingly, the gene expression short-time fluctuations contain a repeating pattern of smaller and smaller parts that are like the whole, but different in size). Secondly, the Markov property of dynamics reflects that the short-time fluctuation governs the full-time behaviour of the system. Here, we succeed in reconstructing naturally the global behavior of the observed distribution of gene expression (i.e., scaling-law) and the local behaviour of the power-law tail of this distribution, by using only these two ingredients: symmetry and the Markov property of dynamics. This approach may represent a step forward toward an integrated image of the basic elements of the whole cell.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 情報処理学会研究報告バイオ情報学（BIO）; 巻 2005, 号 74(2005-BIO-001), p. 17-20, 発行日 2005-07-25
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会