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アイテム
一分子ＤＮＡのＧＣコンテント分布計測における長さ補正
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/59043
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/59043dfd6b1d5-e05b-4265-b5ec-bb21eb3797d8
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO06006009.pdf (436.4 kB)
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Copyright (c) 2006 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2006-09-15 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | 一分子ＤＮＡのＧＣコンテント分布計測における長さ補正 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | The length calibration on GC content distribution measurement for single molecular analysis of DNA | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科情報生命科学専攻 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科情報生命科学専攻 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科情報生命科学専攻 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科情報生命科学専攻 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科情報生命科学専攻 | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Department of Bioinformatics and Genomics，Nara Institute of Science and Technology | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Department of Bioinformatics and Genomics，Nara Institute of Science and Technology | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Department of Bioinformatics and Genomics，Nara Institute of Science and Technology | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Department of Bioinformatics and Genomics，Nara Institute of Science and Technology | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Department of Bioinformatics and Genomics，Nara Institute of Science and Technology | ||||||||
| 著者名 |
藤本, 知之
× 藤本, 知之
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| 著者名(英) |
Tomoyuki, FUJIMOTO
× Tomoyuki, FUJIMOTO
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | これまでに我々はガラス基板上にＤＮＡを伸張固定してＧＣ特異的に蛍光染色し，エバネッセント顕微鏡を用いてＤＮＡを一分子イメージングすることでＤＮＡのＧＣコンテントの一次元分布を計測できた．しかしガラス基板上に固定されたＤＮＡの単位長さ当たりの塩基数が異なるため，データベースの予測と必ずしも一致しない．そこで，塩基数の違いを較正する新たな解析モデルとその適用結果について報告する． | |||||||
| 論文抄録(英) | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | We have analyzed single molecular DNA with single molecular imaging by evanescent field microscope and identified the DNA by comparing measured results of one dimensional distribution of local GC content to estimation from genome database. The number of base pair within the unit length of the DNA fixed on the glass substrates are different from estimation, however, measured results have not matched with genome database well. We report on the new analytic-model and the new application result considering calibration of the difference of the base pair number. | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||
| 書誌情報 |
情報処理学会研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2006, 号 99(2006-BIO-006), p. 63-70, 発行日 2006-09-15 |
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| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
