細胞モデルの連立常微分方程式に対する可解要件と数値計算手順の解析

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2006-12-22
• タイトル: 細胞モデルの連立常微分方程式に対する可解要件と数値計算手順の解析
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Determination of Calculation Procedure for Ordinary Differential Equations of Cell Models using Graph Theoretical Structural Analysis
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 財団法人京都高度技術研究所
• 著者所属: 京都大学情報学研究科
• 著者所属: 京都大学情報学研究科
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): ASTEM Research Institute of Kyoto
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Informatics, Kyoto University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Informatics, Kyoto University
• 著者名: 嶋吉, 隆夫; 天野, 晃; 松田, 哲也
• 著者名(英): TAKAO, SHIMAYOSHI; AKIRA, AMANO; TETSUYA, MATSUDA
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 細胞機能の理解にとって，細胞の生理機能を表現した細胞モデルに対してシミュレーションにより動態解析することは極めて重要である．細胞モデルは一般に連立常微分方程式として定式化されるが，その構成式に非線形連立方程式を含む場合があり，複雑な細胞モデルのシミュレーションプログラムへの実装は多くの労力を必要とする．そこで本研究では，細胞モデルの陽解法シミュレーションを半自動的に実現することを目的とする．本報告では，グラフ理論を用いた連立方程式の構造解析手法を細胞モデルへ適用することによる，可解性判定を利用した境界条件等の指定，方程式変形によるグラフ変換を用いた数値計算量の削減について述べる．
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: The numerical simulation of whole cell models is important to understand cellular mechanisms. However, implementaion of simulation codes of whole cell models, which can include nonlinear equations, formulated as ordinary differential equations demands high effort This research intends to enable automatic numerical calculation of initial-value problems of explicit method of whole cell models. For this purpose, using a graph theoretical method to analyze the structure of equation systems, a method to set boundary conditions with analysis of structural solvability, and a method to reduce numerical calculation cost by transforming of equations are introduced.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 情報処理学会研究報告バイオ情報学（BIO）; 巻 2006, 号 135(2006-BIO-007), p. 127-133, 発行日 2006-12-22
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会