WEKO3
アイテム
可変長ワイルドカード領域を持つ極小な頻出配列パターンの抽出
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/33121
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/331211ca247f5-3cd1-4503-b692-2182782cc730
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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IPSJ-MPS06060003.pdf (503.3 kB)
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Copyright (c) 2006 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2006-06-26 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | 可変長ワイルドカード領域を持つ極小な頻出配列パターンの抽出 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | Mining of Frequent Sequential Patterns with Minimum Cover on Variable-Length Wildcard Regions | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | eng | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 広島市立大学大学院 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 広島市立大学 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 広島市立大学大学院 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 広島市立大学 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 広島市立大学 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 広島市立大学 | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Graduate School of Information Sciences, Hiroshima City University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Faculty of Information Sciences, Hiroshima City University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Graduate School of Information Sciences, Hiroshima City University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Faculty of Information Sciences, Hiroshima City University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Faculty of Information Sciences, Hiroshima City University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Faculty of Information Sciences, Hiroshima City University | ||||||||
| 著者名 |
加藤, 智之
× 加藤, 智之
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| 著者名(英) |
TOMOYUKI, KATO
× TOMOYUKI, KATO
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | 著者らは、アミノ酸配列データベースからモチーフの候補である頻出パターンを抽出するために、極小な可変長ワイルドカード領域を持つ頻出パターンを導き出す方法を提案する。この方法では、k-頻出パターン（長さkの頻出パターン）から（k+1)-頻出パターンを生成するパターン成長アプローチを拡張し、k-頻出パターンごとにスコープデータベースを作成する。スコープデータベースの有効性を示すために、PROSITEからLeucine Zipperモチーフを含むデータセットを取り出し、可変長の頻出パターンを抽出する能力の評価を行ったので、その結果について報告する。 | |||||||
| 論文抄録(英) | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | We propose a method for extracting frequent sequential patterns with minimum variable-wildcard regions, in order to extract candidates of a motif from amino acid sequence databases. A scope database defined by each frequent k-length pattern is constructed by the extension of Projected Database that generate frequent (k+1)-length patterns from a frequent k-length pattern in pattern growth approach. Moreover, we report experimental results that our extended method was evaluated using a dataset that includes the Leucine Zipper motif. | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AN10505667 | |||||||
| 書誌情報 |
情報処理学会研究報告数理モデル化と問題解決（MPS） 巻 2006, 号 68(2006-MPS-060), p. 9-14, 発行日 2006-06-26 |
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| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
