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アイテム
分子動力学法プログラムAMBERとBarnes - Hut tree codeの並列化と性能評価
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/29698
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/296987670ab39-d031-4250-bd46-ee4d89584f0f
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-HPC97069011.pdf (782.3 kB)
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Copyright (c) 1997 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 1997-12-12 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | 分子動力学法プログラムAMBERとBarnes - Hut tree codeの並列化と性能評価 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | Paralelization and Performace Evaluation of MD Program AMBER and Barnes - Hut Tree Code | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 新情報処理開発機構 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| （株）情報数理研究所 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| （株）情報数理研究所 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| （株）アロー | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 新情報処理開発機構 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 新情報処理開発機構 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 新情報処理開発機構 | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Real World Computing Partnership. | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Infoimation and Mathematical Science Laboratory Inc. | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Infoimation and Mathematical Science Laboratory Inc. | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Arrow Co. | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Real World Computing Partnership. | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Real World Computing Partnership. | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Real World Computing Partnership. | ||||||||
| 著者名 |
斎藤, 稔
× 斎藤, 稔
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| 著者名(英) |
Minoru, Saito
× Minoru, Saito
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | 分子動力学シミュレーションのプログラムAMBERとBunes?Hutのtree codeとを、分散メモリ型並列計算機SR2201上でMPI通信ライブラリを使って並列化し実行スピードの評価を行った。AMBERの実行速度は、AMBERのホームページで公表されている速度に比べて飛躍的に向上した。また、Barnes?HUt tree codeの実行速度は、独自の並列化手法によって目覚ましく加速した (28PUsで116倍、256PUsで170倍）。 | |||||||
| 論文抄録(英) | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | We parallelized MD program AMBER and Barnes-Hut tree code using the MPI library and evaluated those performance data on SR2201. The speed of AMBER was remarkably increased by our improvements compared with the performance data of AMBER homepage. On the other hand, the speed of Barnes-Hut tree code was also accelelated by our parallelization approach on SR2201 (116 and 170 times faster for 128 and 256 PUs, respectively). | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AN10463942 | |||||||
| 書誌情報 |
情報処理学会研究報告ハイパフォーマンスコンピューティング（HPC） 巻 1997, 号 121(1997-HPC-069), p. 61-66, 発行日 1997-12-12 |
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| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
