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アイテム
100 Tflopsの分子動力学シミュレーション専用計算機MDMの開発状況
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/29466
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/29466f6ae5764-f173-451f-9ce4-11335e5b58b2
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-HPC00082033.pdf (664.8 kB)
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Copyright (c) 2000 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2000-08-03 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | 100 Tflopsの分子動力学シミュレーション専用計算機MDMの開発状況 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | Development Status of the MDM : 100 Tflops Special - purpose Computer for Molecular Dynamics Simulations | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所情報基盤研究部計算科学技術推進室 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所情報基盤研究部計算科学技術推進室 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所情報基盤研究部計算科学技術推進室 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所情報基盤研究部計算科学技術推進室 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所情報基盤研究部計算科学技術推進室 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 慶應義塾大学理工学部機械工学科 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所情報基盤研究部計算科学技術推進室 | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Computational Science Division, Advanced Computing Center, RIKEN (The Institute of Physical and Chemical Research) | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Computational Science Division, Advanced Computing Center, RIKEN (The Institute of Physical and Chemical Research) | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Computational Science Division, Advanced Computing Center, RIKEN (The Institute of Physical and Chemical Research) | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Computational Science Division, Advanced Computing Center, RIKEN (The Institute of Physical and Chemical Research) | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Computational Science Division, Advanced Computing Center, RIKEN (The Institute of Physical and Chemical Research) | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Department of Mechanical Engineering, Keio University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Computational Science Division, Advanced Computing Center, RIKEN (The Institute of Physical and Chemical Research) | ||||||||
| 著者名 |
成見哲
× 成見哲
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| 著者名(英) |
Tetsu, Narumi
× Tetsu, Narumi
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | 我々は現在100Tflopsの分子動力学シミュレーション専用計算機Molecular Dynamics Machine(MDM)を開発中である。MDMは、Ewald法を用いたクーロン力および分子間力の計算のために専用に開発される計算機であり、タンパク質を含んだ系のようにクーロン力が支配的で大規模な分子動力学シミュレーションを加速することが出来る。MDMはWINE-2、MDGRAPE-2、ホストコンピュータで構成されており、それぞれクーロン力の波数空間部分、クーロン力の実空間部分および分子間力、結合力その他の計算を行う。2000年末に完成予定であり、現在波数空間部分では29Tflopsの実効速度を得た。 | |||||||
| 論文抄録(英) | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | We are now developing Molecular Dynamics Machine (MDM), a 100 Tflops special-purpose computer for classical molecular dynamics simulations. It can accelerate such as a large system with proteins by a specialized hardware for the Coulomb and Van der Waals force calculations. MDM is composed of WINE-2, MDGRAPE-2 and a host computer. WINE-2 accelerates the calculation for wavenumber-space part of the Coulomb force, while MDGRAPE-2 accelerates the calculation for real-space part of the Coulomb and van der Waals forces. The host computer performs other calculations. It will complete at the end of the year 2000. We got 29 Tflops of the effective performance for wavenumber-space part. | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AN10463942 | |||||||
| 書誌情報 |
情報処理学会研究報告ハイパフォーマンスコンピューティング（HPC） 巻 2000, 号 73(2000-HPC-082), p. 191-196, 発行日 2000-08-03 |
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| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
