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アイテム
RCGAToolbox: 動力学モデルのパラメーター推定のための実数値遺伝的アルゴリズムソフトウェア
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/216930
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/2169307beff3e2-60b3-429b-872b-2925fb3d9823
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO22069020.pdf (3.1 MB)
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Copyright (c) 2022 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2022-03-03 | |||||||||||
| タイトル | ||||||||||||
| タイトル | RCGAToolbox: 動力学モデルのパラメーター推定のための実数値遺伝的アルゴリズムソフトウェア | |||||||||||
| 言語 | ||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| 九州工業大学大学院情報工学研究院生命化学情報工学研究系／科学技術振興機構さきがけ | ||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| Department of Molecular Cell Biology, Faculty of Science, VU University Amsterdam | ||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| 九州工業大学大学院情報工学研究院生命化学情報工学研究系 | ||||||||||||
| 著者名 |
前田, 和勲
× 前田, 和勲
× Fred, C. Boogerd
× 倉田, 博之
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| 論文抄録 | ||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||
| 内容記述 | 代謝経路やシグナル伝達経路のような生化学ネットワークの挙動を理解するには動力学モデルが不可欠である．この動力学モデルを構築する上で，動力学パラメーターの推定がボトルネックとなっている．この問題を解決するために，我々はRCGAToolboxを開発した．これは数値計算環境MATLAB上で動作する動力学パラメーター推定ソフトウェアであり，アルゴリズムとしては実数値遺伝的アルゴリズムを提供する．さらに，グラフィカルユーザーインターフェースを持っており，並列計算などの高度なオプションも簡単に使用できる．この本稿では，RCGAToolboxの概要と遺伝子回路設計問題への応用について紹介する．RCGAToolboxはGitHubで入手できる． | |||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2022-BIO-69, 号 20, p. 1-6, 発行日 2022-03-03 |
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| ISSN | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8590 | |||||||||||
| Notice | ||||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||||
