デング熱ウイルス感染経過データに対する動的ネットワークバイオマーカー解析の適用

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2020-03-05
• タイトル: デング熱ウイルス感染経過データに対する動的ネットワークバイオマーカー解析の適用
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Application of Dynamical Network Biomarker analysis to dengue fever virus infection data
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 富山大学大学院理工学教育部
• 著者所属: 富山大学学術研究部都市デザイン学系
• 著者所属: 富山大学工学部
• 著者所属: 富山大学学術研究部薬学・和漢系
• 著者所属: 富山大学学術研究部薬学・和漢系
• 著者所属: 富山大学学術研究部薬学・和漢系
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Science and Enginieering, University of Toyama
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Faculty of Sustainable Design, Academic Assembly, University of Toyama
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): School of Engineering, University of Toyama
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Faculty of Pharmaceutical Sciences, Academic Assembly, University of Toyama
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Faculty of Pharmaceutical Sciences, Academic Assembly, University of Toyama
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Faculty of Pharmaceutical Sciences, Academic Assembly, University of Toyama
• 著者名: 村田, 健哉; 春木, 孝之; 吉田, 泰彦; 奥, 牧人; 小泉, 桂一; 門脇, 真
• 著者名(英): Kenya, Murata; Takayuki, Haruki; Yasuhiko, Yoshida; Makito, Oku; Keiichi, Koizumi; Makoto, Kadowaki
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 動的ネットワークバイオマーカー (DNB) はバイオマーカーの揺らぎ，それらの間の相関から健康状態と疾患状態の間の未病状態を検出することができる．この未病状態を検出するため，様々な生命系オープンデータに対する DNB 解析の適用が試みられている．本研究では，Cytometry by Time Of Flight (CyTOF) 装置により得られたデング熱ウイルス感染経過データに対して DNB 解析を行い，DNBタンパク質が抽出されるかどうか，また遷移状態を検出できるかどうかを調べた．解析の結果，デング熱ウイルス 2 型の感染処理後 8 時間において，ウイルスの Envelope，免疫に関係するタンパク質 IL-1β，TNFα が DNB タンパク質として得られた．少数のタンパク質の揺らぎが検出されたため，この時点はデング熱ウイルス感染初期の遷移状態であると考えられる．
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: Dynamical Network Biomarker (DNB) can detect pre-disease (“Mibyou”) state between health and disease states from the fluctuation of biomarkers and the correlation between them. Recently, the application of DNB analysis into various biological open data has been attempted to detect the pre-disease state. In this study, we performed the DNB analysis on the dengue fever virus infection data obtained by Cytometry by Time Of Flight (CyTOF) instrument, and then examined whether DNB proteins can be extracted and whether the pre-disease state can be detected. These numerical results showed that the virus Envelope, and the immune proteins IL-1β and TNFα were obtained as DNB proteins at 8 hours after infection with the dengue fever virus serotype 2. Therefore, we suggest that this time point (8h) indicates the pre-disease state of the initial infection after the dengue fever virus.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 研究報告バイオ情報学（BIO）; 巻 2020-BIO-61, 号 2, p. 1-6, 発行日 2020-03-05
• ISSN / 収録物識別子タイプ: ISSN
• ISSN / 収録物識別子: 2188-8590
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会