| Item type |
SIG Technical Reports(1) |
| 公開日 |
2019-11-25 |
| タイトル |
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タイトル |
注意機構付きLSTMを用いた抗原タンパク質のエピトープ領域予測 |
| タイトル |
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言語 |
en |
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タイトル |
Epitope Prediction of Antigen Protein using Attention-Based LSTM Network |
| 言語 |
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言語 |
jpn |
| キーワード |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
バイオインフォマティクス |
| 資源タイプ |
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資源タイプ識別子 |
http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh |
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資源タイプ |
technical report |
| 著者所属 |
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フューチャー株式会社／東京大学大学院 |
| 著者所属 |
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フューチャー株式会社 |
| 著者所属 |
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フューチャー株式会社 |
| 著者所属 |
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株式会社ファンペップ |
| 著者所属 |
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株式会社ファンペップ |
| 著者所属 |
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大阪大学大学院 |
| 著者所属(英) |
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en |
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Future Corporation / The University of Tokyo |
| 著者所属(英) |
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en |
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Future Corporation |
| 著者所属(英) |
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en |
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Future Corporation |
| 著者所属(英) |
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en |
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FunPep Co., Ltd. |
| 著者所属(英) |
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en |
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FunPep Co., Ltd. |
| 著者所属(英) |
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en |
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Osaka University Graduate School of Medicine |
| 著者名 |
農見, 俊明
藤田, 春佳
貞光, 九月
坂口, 誠
天満, 昭子
中神, 啓徳
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| 著者名(英) |
Toshiaki, Noumi
Haruka, Fujita
Kugatsu, Sadamitsu
Makoto, Sakaguchi
Akiko, Tenma
Hironori, Nakagami
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| 論文抄録 |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
生体内において抗原に特異的な免疫応答を誘導する B 細胞は，抗原タンパク質の部分領域 （エピトープ領域） を認識することで抗原特異的な抗体を大量に産生し，抗体を抗原タンパク質に結合させることでその機能を阻害することができる．エピトープ領域を予測することは，抗原に特異的な抗体産生を誘導するワクチンの設計 ・開発のために有益であり，予測精度の向上が求められている．従来のエピトープ領域予測手法では，抗原タンパク質全体のアミノ酸配列のうち予測対象配列のみに注目しており，抗原タンパク質全体の配列や特徴量を十分に考慮できていなかった．本研究では，予測対象配列に加え抗原タンパク質全体の特徴を考慮するために深層学習の一種である注意機構付き LSTM の適用法を提案する．提案法は IEDB データを用いた実験において，従来法によるエピトープ領域予測精度を上回る精度を示した． |
| 書誌レコードID |
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収録物識別子タイプ |
NCID |
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収録物識別子 |
AA12055912 |
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO）
巻 2019-BIO-60,
号 3,
p. 1-6,
発行日 2019-11-25
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| ISSN |
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収録物識別子タイプ |
ISSN |
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収録物識別子 |
2188-8590 |
| Notice |
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SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. |
| 出版者 |
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言語 |
ja |
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出版者 |
情報処理学会 |
IPSJ-BIO19060003.pdf (765.9 kB)
