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トピックモデルによる野外トランスクリプトームデータの解析
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/142460
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/1424601310a29e-e422-483a-a213-cdec82678762
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-MPS15103059.pdf (766.3 kB)
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Copyright (c) 2015 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2015-06-16 | |||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||
| タイトル | トピックモデルによる野外トランスクリプトームデータの解析 | |||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 龍谷大学農学部 | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 京都大学生態学研究センター | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 日本学術振興会 | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 龍谷大学農学部／京都大学生態学研究センター／科学技術振興機構さきがけ | ||||||||||||||
| 著者名 |
岩山, 幸治
× 岩山, 幸治
× 本庄, 三恵
× 岩崎, 貴也
× 永野, 惇
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| 論文抄録 | ||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||
| 内容記述 | トピックモデルとは，従来自然言語処理の分野において，膨大な単語から成る大量の文書データを少数のトピックで表現する手法である．近年，分子生物学や生態学など他分野への応用がなされてきている．遺伝子を単語，各サンプルを文書，遺伝子の発現を文書中への単語の出現と対応させることで，トランスクリプトームデータへトピックデータを適用することができる．本研究では，野外の複雑な環境における遺伝子発現の変動を解析するため，野外で生育するイネのトランスクリプトームデータをトピックモデルにより解析した．その結果，膨大な遺伝子の発現量の変動を少数のトピックの確率の切り替わりで表現できることを示す． | |||||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||
| 収録物識別子 | AN10505667 | |||||||||||||
| 書誌情報 |
研究報告数理モデル化と問題解決（MPS） 巻 2015-MPS-103, 号 59, p. 1-2, 発行日 2015-06-16 |
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| ISSN | ||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8833 | |||||||||||||
| Notice | ||||||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||||||
