遺伝子ネットワークのreduced S-systemモデルの効率的同定法の提案

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2015-03-13
• タイトル: 遺伝子ネットワークのreduced S-systemモデルの効率的同定法の提案
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 鳥取大学
• 著者所属: 基礎生物学研究所
• 著者所属: 理化学研究所
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Tottori University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): National Institute for Basic Biology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): RIKEN
• 著者名: 木村, 周平; 佐藤, 昌直; 岡田(畠山), 眞里子
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 遺伝子ネットワーク同定とは，観察された遺伝子発現データに合うような遺伝子ネットワークのモデルのパラメータを推定する問題のことである．遺伝子ネットワークを記述するために多くの数理モデルが提案されているが，中でも S-system モデルは最も使用されてモデルの一つである． S-system モデルは生化学反応を近似したモデルであり，遺伝子ネットワークの記述に適していると考えられている．そのため S-system モデルを用いた遺伝子ネットワーク同定法が，これまでに数多く提案されている．しかしながら S-system に含まれるパラメータ数は，他の頻繁に使用されているモデルのパラメータ数よりも多い．従って遺伝子ネットワークの S-system モデルを同定するためには，より多くの遺伝子発現データを与える必要があると考えられる．遺伝子ネットワーク同定に必要な遺伝子発現データの量を減らすために，本研究では S-system モデルの一部のパラメータを 0 に固定することでモデルを単純化する．本研究では単純化した S-system モデルを，reduced S-system モデルと呼ぶ．次に遺伝子ネットワークの reduced S-system モデルを効率的に同定するための新たな方法を提案する．最後に数値実験を通して，提案手法の有効性を示す．
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 研究報告バイオ情報学（BIO）; 巻 2015-BIO-41, 号 8, p. 1-6, 発行日 2015-03-13
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会